Kocioł kondensacyjny zużywa mniej paliwa niż konwencjonalny; różnica jest największa podczas łagodnej zimy; ma zamkniętą komorę spalania – jest więc bezpieczniejszy i nie wychładza pomieszczenia, w którym jest zainstalowany; jest droższy od zwykłego kotła; wytwarza dużo kwaśnych skroplin, więc elementy komina muszą być szczególnie odporne na korozję; trzeba odprowadzać z niego skropliny do kanalizacji; trudno znaleźć model o takiej trwałości, jaką mają niekondensacyjne stojące kotły żeliwne.